Theo các nhà nghiên cứu, số phận ngôi nhà Bá Kiến cũng thăng trầm như chủ nhân của nó với nhiều biến cố: Từng bị cháy và suýt bị "xẻ thịt" để lấy gỗ nhưng vẫn tồn tại đến ngày nay.